Antichissimo programma del MatriX il Merovingio è uno dei personaggi più potenti che si possa incontrare, innumerevoli sono i programmi al suo servizio ( la maggior parte dei quali pericolosi come Vlad, Abel, Kain e l'Uomo del Treno ). Non c'è cosa che avvenga nel MatriX di cui non sia al corrente e in ogni affare importante c'è il suo zampino. Mellifluo sfuggente e strafottente il Merovingio è un personaggio contraddittorio ed enigmatico una figura potente e pericolosa che ha l'unica debolezza nella sua troppa fiducia in se stesso.

Bellissima, enigmatica e dalla personalità contorta Phersepone oltre ad essere la moglie del Merovingio ne è anche una forte debolezza ( infatti sentendosi spesso, giustamente, tradita da lui non esita a ricambiarlo con dei tiri mancini ). Una particolarità di Phersepone è quella di chiedere in cambio di un favore un bacio, sembra infatti che dopo aver baciato qualcuno lei riesca a condividerne e pensieri e le emozioni.
* L'arma di Phersepone è caricata a pallottole d'argento e può uccidere per questo i programmi licantropi al servizio di suo marito.

Sei siano veramente i due personaggi biblici non ci è dato saperlo, l'unica cosa certa è che sono fantasmi al servizio del Merovingio. Violenti aggressivi e dal carattere da attaccabrighe sono poco propensi alle chiacchiere ma piuttosto all'azione ( specialmente se comporta morti e distruzione ).  Possiedono il potere di diventare intangibili e in quello stato nessuna arma fisica può danneggiarli, nonostante ciò in quello stato non sono in grado di attaccare o interagire con il mondo ma posso farlo con ciò che hanno addosso come ricaricare un arma o spiegare il rasoio.

Definito dal Merovingio come un "mezzo" il fabbricante di chiavi come suggerisce il suo stesso nome è in grado di fabbricare chiavi di accesso per qualunque cosa, aprire ogni porta ( comprese le Backdoors, le porte di accesso segrete del MatriX ) o anche semplici chiavi di avviamento per un mezzo fino alla chiave che apre la porta di accesso la mainframe delle macchine in cui l'eletto deve recarsi.

Dopo essere stato sconfitto da Neo Smith si è in qualche modo evoluto in una specie di Virus, non essendo più collegato al sistema può spostarsi liberamente e colpendo una persona con un pugno può tentare di infettarla tramutandolo in un suo clone con medesime caratteristiche, per impossessarsi di una persona deve ( dopo averla colpita ) vincerla in un confronto MAN contro MAN ( in questo caso la MAN di Smith va raddoppiata! ). E' anche in grado, attraverso una linea telefonica fissa e collegata di impossessarsi del corpo di un uomo nel mondo reale.

Johnson è il nuovo Smith, ne ha preso il posto dopo la disfatta per mano di Neo, essendo un modello di agente più recente rispetto a Smith, Brown e Jones è decisamente più forte di un comune agente e programmato per essere un vero mastino, infatti Johnson sembra quasi essere onnisciente e sempre pronto a manifestarsi nei momenti di maggiore crisi per i nostri eroi.

Serafh è come lui stesso si definisce "colui che protegge ciò che ha più valore", è un programma che si potrebbe definire un angelo custode, egli serve e proteggere l'Oracolo con una fedeltà cieca, quando questa glielo chiede aiuta Morpheus e Trinity a strappare Neo dalle grinfie del Merovingio ( a tal riguardo sembra che in passato Serafh abbia avuto particolari rapporti con il Merovingio dei quali non ci è dato sapere ).

Forse il programma più potente del MatriX l'oracolo è in grado di comprendere, al contrario dei suoi simili, il comportamento umano, alleata da tempo immemore con gli uomini ha predetto la venuta dell'eletto. L'Oracolo crede fermamente che il futuro possa essere raggiunto solo con la pace fra gli umani e le macchine e sarà lei a credere fino alla fine in Neo e ad aiutarlo quando tutto sembrerà perduto. L'Oracolo sembra sapere ogni cosa e appare impossibile reagire con una mossa da lei non anticipatamente prevista.

Link è un uomo che fa il suo lavoro, diventato operatore sulla Nabuccodonosor in seguito ad una promessa fatta a Dozer ( anche contro il volere di sua moglie Zee ) egli alla fine crederà a Morpheus e si dimostrerà una persona tenace e determinata al punto da sopravvivere all'assalto finale delle macchine a Zion e riabbracciare così Zee.

Consigliere tra i più importanti di Zion Hamann sembra quello più scaltro, intelligente e dalla parlantina sciolta non crede ciecamente nella profezia dell'Oracolo ma nemmeno la rinnega. Si dimostra interessato a Neo e nel suo piccolo cerca di spronarlo a trovare le risposte ai suoi dubbi prima che la gente di Zion ne paghi le conseguenze.

Capitano della Hammer e uomo estremamente ligio al dovere Roland si è sempre dimostrato scettico verso la fede assoluta di Morpheus. Non che non sia un bravo capitano ma a volte la sua logica lo fa sembrare di mentalità ristretta,  Roland rimane molto stupito quando Niobe lascia la sua nave a Neo e Trinity per intraprendere una missione disperata ma si dimostra comunque un abile guerriero tornando sano e salvo a casa.